Была аналогичная ситуация у меня. Сайт имел неплохие позиции в ПС, однако меня не устраивал движок, поэтому я решил перенести сайт на вордпресс, так как у меня достаточный опыт работы. Что я сделал:
1) создал поддомен на имеющемся домене (можно как и вы, регистрировать новый и там делать сайт, но не вижу в этом смысла - поддомен бесплатен)
2) на этом поддомене сделал сайт, запрещенный к индексации, который мне нужен
3) настроил все редиректы со страниц старого сайта на новый - их было тоже около 500, все делал руками (редиректы можно было настроить только на поддомен, но это не важно - урлы, кстати, не совпадали и были на старом сайте ужасны)
4) удалил старый сайт, перенес мой новый с поддомена на новый домен, переписав запросами в БД адрес поддомена на домен (в этом случае все редиректы стали рабочие) - эта операция заняла 5 минут времени, так как переписать урлы в БД можно заранее
Думаю в вашем случае все аналогично, базы данных они везде базы данных. Но как понимаю, редиректы можно настроить не обязательно через плагин, а через .htacsess по-моему.
Итог моих переносов - сайт просел в выдаче на ровно на 50% на 6 месяцев, после этого позиции и посещаемость вернулись на прежнее место.
Сайт, правда, некоммерческий.
